学校发端于陈嘉庚先生1918年以来在厦门集美学村创办的系列专门学校。1994年10月，经原**教育委员会批准，原交通部所属的集美航海学院、原农业部所属的厦门水产学院、福建省所属的福建体育学院、集美财经高等专科学校和厦门市所属的集美师范高等专科学校等五所高等学校合并组建为集美大学。学校于1999年1月实现实质性合并。2004年，厦门市工业学校成建制并入集美大学。2013年7月，国务院学位委员会发文正式批准集美大学为博士学位授予单位，船舶与海洋工程、水产等2个学科为博士学位授权一级学科。2018年，集美大学入选福建省“双一流”建设高校。其中，该校入选高峰学科建设学科2个，高原学科建设学科4个。

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